1836ko errege-agindu baten ondorioz sortu zen Artxibo Nagusia. Jose Yanguas y Miranda izan zen lehenengo artxibozaina. XIX. mendearen hasieran Diputazioaren ardurapean geratu zen eta Nafarroako Jauregiaren ondoan kokatu zuten. Suspertzaile nagusien artean Iturralde y Suit eta Arturo Campion. 2003. urtetik egungo egoitzan dago.